Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRAMP1Q96RY5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRAMP1Q96RY5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms