Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF48Q96MX3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF48Q96MX3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF48Q96MX3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF48Q96MX3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF48Q96MX3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF48Q96MX3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF48Q96MX3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF48Q96MX3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF48Q96MX3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF48Q96MX3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms