Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms