Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE4DIPQ5VU43 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4DIPQ5VU43 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms