Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hectd3Q3U487 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hectd3Q3U487 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms