Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOXD1Q16676 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXD1Q16676 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
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