Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
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TCOF1Q13428 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
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TCOF1Q13428 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TCOF1Q13428 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
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TCOF1Q13428 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
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TCOF1Q13428 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TCOF1Q13428 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TCOF1Q13428 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TCOF1Q13428 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
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TCOF1Q13428 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
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TCOF1Q13428 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCOF1Q13428 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
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TCOF1Q13428 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
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TCOF1Q13428 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TCOF1Q13428 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TCOF1Q13428 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TCOF1Q13428 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TCOF1Q13428 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TCOF1Q13428 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TCOF1Q13428 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCOF1Q13428 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCOF1Q13428 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCOF1Q13428 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCOF1Q13428 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCOF1Q13428 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TCOF1Q13428 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
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