Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP3CAQ08209 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP3CAQ08209 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms