Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ErfP70459 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ErfP70459 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ErfP70459 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ErfP70459 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ErfP70459 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ErfP70459 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ErfP70459 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ErfP70459 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ErfP70459 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ErfP70459 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ErfP70459 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ErfP70459 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ErfP70459 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ErfP70459 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ErfP70459 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ErfP70459 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ErfP70459 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ErfP70459 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms