Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ufd1P70362 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ufd1P70362 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufd1P70362 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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