Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP12AP54707 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms