Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SMARCA2P51531 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA2P51531 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA2P51531 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms