Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PPARGP37231 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PPARGP37231 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PPARGP37231 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PPARGP37231 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PPARGP37231 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PPARGP37231 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms