Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEFMP07197 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEFMP07197 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NEFMP07197 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NEFMP07197 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFMP07197 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFMP07197 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFMP07197 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFMP07197 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFMP07197 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFMP07197 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFMP07197 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NEFMP07197 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NEFMP07197 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NEFMP07197 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms