Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NCBP2LA6PVI3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms