Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVL5

Uncharacterized protein FLJ43738 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVL5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVL5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A1B0GVL5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GVL5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GVL5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GVL5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A1B0GVL5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A1B0GVL5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms