Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RPL5P4-201ENST00000434805 886 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC01728-201ENST00000428529 524 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL161626.1-201ENST00000441480 490 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CEP44Q9C0F1 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms