Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.2 ms