Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC124283.2-201ENST00000575085 318 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CBWD5-209ENST00000430059 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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