Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
USF2Q15853 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
USF2Q15853 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
USF2Q15853 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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USF2Q15853 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 DIMT1P1-201ENST00000603970 763 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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