Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms