Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ERVK-21P61565 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms