Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD13P35453 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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