Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CICP10-201ENST00000439497 198 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC006387.1-203ENST00000494849 342 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC116049.2-201ENST00000508572 754 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PGAM4P2-201ENST00000512491 721 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC103409.1-201ENST00000521199 564 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AP001782.1-202ENST00000527774 445 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MIR3689F-201ENST00000579617 66 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 TTN-AS1-215ENST00000585451 949 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC006115.1-201ENST00000599726 517 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 XPNPEP3-206ENST00000614001 230 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AC016582.3-206ENST00000636547 207 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PACRG-202ENST00000366888 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 PRLR-213ENST00000514088 1440 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ANGPT1-206ENST00000520734 1526 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPREB1P12018 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms