Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 SETP22-201ENST00000412243 957 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC078788.2-201ENST00000462300 382 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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ARL2-SNX15V9GYD0 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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ARL2-SNX15V9GYD0 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 DCN-215ENST00000550099 719 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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