Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms