Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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USP18Q9UMW8 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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