Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 RPL5P8-201ENST00000396820 815 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC108120.1-201ENST00000506543 991 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 KCNJ15-205ENST00000398930 2914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 TMPRSS11D-201ENST00000283916 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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