Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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RTL8BQ17RB0 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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RTL8BQ17RB0 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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RTL8BQ17RB0 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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RTL8BQ17RB0 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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RTL8BQ17RB0 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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RTL8BQ17RB0 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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