Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SS18Q15532 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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SS18Q15532 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SS18Q15532 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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