Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms