Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
CUL4AQ13619 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 317.7 ms