Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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TCIRG1Q13488 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
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TCIRG1Q13488 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TCIRG1Q13488 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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