Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OGFOD1P1-201ENST00000447552 1592 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LST1-211ENST00000376110 433 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 NDUFB4P1-201ENST00000462398 381 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC106760.2-201ENST00000504159 619 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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