Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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FOXF2Q12947 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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FOXF2Q12947 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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FOXF2Q12947 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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FOXF2Q12947 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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FOXF2Q12947 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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FOXF2Q12947 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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FOXF2Q12947 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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