Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PTPRB-209ENST00000550857 5839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 HUS1-201ENST00000258774 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL355375.1-201ENST00000405686 392 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
HOXD8P13378 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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