Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SH3BP1Q9Y3L3 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms