Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms