Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CLDN19Q8N6F1 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CLDN19Q8N6F1 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CLDN19Q8N6F1 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CLDN19Q8N6F1 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CLDN19Q8N6F1 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CLDN19Q8N6F1 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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CLDN19Q8N6F1 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CLDN19Q8N6F1 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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