Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MADD-202ENST00000342922 6005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZNF608-201ENST00000306315 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 HERC3-201ENST00000264345 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 OTOF-201ENST00000272371 7156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PTGS1-202ENST00000362012 4964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ELP4-218ENST00000639570 5795 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TRPM3-213ENST00000396285 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL365217.1-201ENST00000398578 2436 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ESR1-206ENST00000427531 5436 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ACOT11-202ENST00000371316 6369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ABHD18-201ENST00000388795 5450 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MYO7B-202ENST00000409816 6694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 LY75-CD302-201ENST00000504764 5650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AKAP4-202ENST00000376064 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL035422.2-201ENST00000603059 565 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NBPF19-203ENST00000578189 5034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NVL-211ENST00000469075 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ENPEP-201ENST00000265162 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZNF493-201ENST00000339914 1665 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 5570 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 ZNF557-202ENST00000414706 5736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RYR3Q15413 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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