Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 ENOX1-AS1-201ENST00000444442 3907 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 TRBV25-1-202ENST00000390398 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 CNN3P1-201ENST00000401596 935 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SSPNQ14714 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms