Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
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CNGB1Q14028 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
CNGB1Q14028 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
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