Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
ITGB3BPQ13352 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms