Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
GPS1Q13098 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.4 ms