Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SREBF2Q12772 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 CREM-208ENST00000361599 2170 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
SREBF2Q12772 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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