Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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SOX4Q06945 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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SOX4Q06945 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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SOX4Q06945 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 DLEU1-AS1-201ENST00000428276 731 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SOX4Q06945 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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