Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms