Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 PLA2G7-202ENST00000537365 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 EBLN2-201ENST00000533473 1679 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 LINC01653-201ENST00000456026 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LMOD1P29536 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129 ms