Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMG5Q9UPR3 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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