Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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